Ngày 28 tháng 06 năm 2016, Bộ Khoa học và Công nghệ và Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư liên tịch số 12/2016/TTLT-BKHCN-BTC hướng dẫn về nội dung chi và quản lý Quỹ phát triển khoa học và công nghệ của doanh nghiệp. Theo đó, thông tư quy định một số nội dung sau:
Các doanh nghiệp được thành lập theo quy định của pháp luật, các cơ quan nhà nước, tổ chức, cá nhân khác có liên quan được thành lập Quỹ phát triển khoa học và công nghệ . Quỹ có thể được tổ chức dưới hai hình thức:
- Thành lập tổ chức không có tư cách pháp nhân và trực thuộc doanh nghiệp.
- Không thành lập tổ chức Quỹ và do cán bộ của doanh nghiệp kiêm nhiệm thực hiện các hoạt động.
Quỹ được hình thành từ hai nguồn:
- Thu nhập tính thuế TNDN trong kỳ tính thuế;
Mức trích lập quỹ đối với doanh nghiệp ngoài nhà nước là do doanh nghiệp tự quyết định mức trích cụ thể nhưng tối đa không quá 10% thu nhập tính thuế TNDN trong kỳ.
- Điều chuyển từ Quỹ phát triển khoa học và công nghệ của tổng công ty, công ty mẹ xuống Quỹ phát triển khoa học và công nghệ của các công ty con hoặc doanh nghiệp thành viên; Điều chuyển từ Quỹ phát triển khoa học và công nghệ của các công ty con, doanh nghiệp thành viên về Quỹ phát triển khoa học và công nghệ của tổng công ty, công ty mẹ.
Việc Điều chuyển Quỹ không áp dụng đối với một số trường hợp: Doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài điều chuyển cho công ty mẹ ở nước ngoài và Công ty mẹ ở Việt Nam điều chuyển cho công ty con ở nước ngoài.
Ngoài ra, Thông tư quy định về các nội dung chi của quỹ và quản lý quỹ.
Thông tư này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 01 tháng 09 năm 2016 và áp dụng cho việc trích lập, quản lý và sử dụng Quỹ khoa học và công nghệ tại doanh nghiệp từ kỳ tính thuế thu nhập doanh nghiệp năm 2016.
