Ngày 24 tháng 10 năm 2019, Cục thuế Thành phố Hà Nội ban hành công văn số 80504/CT-TTHT. Theo đó:
Trường hợp công ty có Chi nhánh tại địa bản khác tỉnh với trụ sở chính, là cơ sở sản xuất phụ thuộc, không thực hiện hạch toán kế toán mà hạch toán tập trung ở trụ sở chính. Hoạt động của Chi nhánh là gia công sản phẩm, tạo thành bán thành phẩm sau đó chuyển về trụ sở chính để tiếp tục gia công thành phẩm sản phẩm hoàn thiện. Chi nhánh không trực tiếp bán hàng mà Trụ sở chính trực tiếp bán hàng qua các cửa hàng, kênh phân phối thì :
– Về thuế GTGT: Công ty thực hiện khai thuế GTGT tại trụ sở chính và nộp thuế GTGT cho Cục thuế nơi có cơ sở sản xuất trực thuộc. Số thuế GTGT phải nộp cho Cục thuế nơi có cơ sở sản xuất trực thuộc được xác định theo tỷ lệ 2% đối với hàng hóa chịu thuế suất thuế GTGT 10% trên doanh thu theo giá chưa có thuế GTGT của sản phẩm sản xuất ra. Công ty phải lập và gửi “Bảng phân bổ thuế GTGT cho địa phương nơi đóng trụ sở chính và cho các địa phương nơi có cơ sở sản xuất trực thuộc không thực hiện hạch toán kế toán” theo mẫu số 01-6/GTGT của Thông tư 156/2013/TT-BTC cùng với hồ sơ khai thuế tới Cục thuế nơi đóng trụ sở chính, đồng thời gửi một bản Bảng phân bổ mẫu số 01-6/GTGT nêu trên tới Cục thuế nơi có cơ sở sản xuất trực thuộc.
– Thuế TNDN: Công ty kê khai thuế TNDN tập trung tại trụ sở chính cả phần phát sinh tại nơi đóng trụ sở chính và ở nơi có cơ sở sản xuất hạch toán phụ thuộc. Việc xác định tỷ lệ, số thuế phải nộp cho Kho bạc Nhà nước đồng cấp với cơ quan thuế tại trụ sở chính và tại địa phương nơi đặt địa điểm sản xuất thực hiện theo hướng dẫn tại điều 12, Điều 13 Thông tư số 78/2014/ TT-BTC.
– Thuế TNCN: trường hợp toàn bộ lao động làm việc tại chi nhánh ký hợp đồng lao động với Công ty và được cử đến chi nhánh làm việc, đăng ký giảm trừ cho bản thân tại Công ty, Công ty thực hiện việc chi trả thu nhập thì kê khai nộp thuế tại cơ quan thuế nơi đặt trụ sở chính.