Ngày 09 tháng 05 năm 2016, Tổng cục Thuế ban hành Công văn số 1964/TCT-CS hướng dẫn khấu trừ VAT thuế nhà thầu bị truy thu. Theo đó, trường hợp Công ty có ký hợp đồng với nhà thầu nước ngoài nhưng Công ty không kê khai, nộp thuế thay nhà thầu nước ngoài theo quy định. Khi Cơ quan thuế kiểm tra thuế tại trụ sở Công ty và đã truy thu thuế GTGT nộp hộ nhà thầu nước ngoài thì Công ty không được kê khai khấu trừ bổ sung số thuế GTGT bị truy thu này.
