Ngày 09 tháng 09 năm 2021, Tổng Cục thuế ban hành công văn số 3393/TCT-CS, theo đó:
Doanh nghiệp chế xuất không phải người nộp thuế giá trị gia tăng. Tại thời điểm nộp hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT, doanh nghiệp đã chuyển thành doanh nghiệp chế xuất thì dự án đầu tư của doanh nghiệp không thuộc trường hợp được hoàn thuế Giá trị gia tăng.
Đối với doanh nghiệp thực hiện chuyển đổi sở hữu, chuyển đổi doanh nghiệp (chuyển đổi theo quy định của Luật doanh nghiệp) được hoàn thuế GTGT theo quy định. Việc chuyển từ doanh nghiệp thông thường sang doanh nghiệp chế xuất không thuộc các trường hợp chuyển đổi doanh nghiệp theo quy định tại Luật Doanh nghiệp.