Ngày 27 tháng 08 năm 2019, Cục thuế thành phố Hà Nội ban hành công văn số 67620/CT-TTHT. Theo đó:
Trường hợp Công ty cung cấp dịch vụ vận tải hàng hóa theo chặng quốc tế từ Việt Nam ra nước ngoài hoặc từ nước ngoài đến Việt Nam, hoặc cả điểm đi và đến ở nước ngoài, bao gồm cả chặng vận tải nội địa thì vận tải quốc tế bao gồm cả chặng nội địa thuộc đối tượng áp dụng thuế suất thuế GTGT 0% nếu đáp ứng điều kiện quy định tại tiết c khoản 2 Điều 9 Thông tư số 219/2013/TT-BTC. Để được khấu trừ thuế GTGT đầu vào của dịch vụ xuất khẩu thì Công ty phải đáp ứng theo hướng dẫn tại Điều 16 Thông tư số 219/2013/TT-BTC (được sửa đổi bổ sung tại khoản 7 Điều 3 Thông tư số 119/2014/TT-BTC và khoản 11 Điều 1 Thông tư số 26/2015/TT-BTC).
Các dịch vụ bổ sung khác liên quan đến hoạt động gom hàng và vận tải quốc tế nếu không đáp ứng điều kiện để xác định là dịch vụ xuất khẩu theo quy định tại tiết b khoản 1, tiết b khoản 2 Điều 9 Thông tư số 219/2013/TT-BTC thì thuộc đối tượng áp dụng thuế suất thuế GTGT 10%. Trường hợp Công ty kinh doanh nhiều loại hàng hóa, dịch vụ có mức thuế suất GTGT khác nhau phải khai thuế GTGT theo từng mức thuế suất quy định đối với từng loại hàng hóa, dịch vụ; nếu Công ty không xác định theo từng mức thuế suất thì phải tính và nộp thuế theo mức thuế suất cao nhất của hàng hóa, dịch vụ mà Công ty cung cấp.
